O retábulo-mor e as imagens de São Francisco e Santo António
O arco de retábulo por cima do sacrário, onde está, por vezes, o Menino Deus, é muito singelo, sendo, provavelmente, um dos mais antigos em estilo rococó. É côncavo, com uma coluna e edícula de cada lado, numa variação de um desenho de outras obras conhecidas desse tempo. O desenho deste retábulo, pode ser do entalhador José Pereira Veloso, não só pelos seus pormenores, mas também pelo facto de ele ter sido testemunha no ato em que foi celebrado o contrato do retábulo. Porém, há opiniões divergentes, que afirmam que o retábulo poderá ter o risco das mãos de José Álvares de Araújo.
Ainda no altar-mor, nas peanhas decorativas designadas de “rocalhas”, foram colocadas duas imagens trazidos pela Venerável Ordem Terceira de S. Francisco, quando tomou conta da igreja do Recolhimento, provenientes da demolida igreja dos Terceiros, em 1931. Trata-se de duas imagens do século XVIII ou XIX, que representam: do lado do evangelho, S. Francisco de Assis e do lado da epístola, Santo António de Lisboa.
A escultura policromada de São Francisco de Assis surge sobre uma base retangular preta, de três níveis e um globo azul adornado por estrelas prateadas de sete pontas. Apresenta-se com as vestes monacais de capuchinho adornada por friso dourado, cingido na cinta por um cordão dourado, que cai quase até aos pés. As mangas são debruadas a dourado, e recolhidas. Perna direita levemente dobrada. Na mão direita suporta uma caveira e na esquerda um crucifixo, cilíndrico, enfeitado por ramos cortados e pela imagem de Cristo Crucificado. As chagas estão assinaladas a tinta vermelha no centro dos pés descobertos e das mãos, estigmas da visão de Cristo Crucificado. Rosto carregado e com olhar baixo, mas voltado ligeiramente para a esquerda. Surge retratado com barba bifurcada e cabelo castanho curto e ondulado. Encimado por resplendor que detém ao centro uma pedra vermelha.
Do lado da epístola, e ao mesmo nível, encontramos uma escultura de Santo António de Lisboa, policromada e dourada. É uma figura masculina com Menino, em vulto pleno, de pé em posição frontal. Surge representado com um rosto jovem, de cabelos curtos e ondulantes, cabeça ligeiramente inclinada para a esquerda, como que a pregar. O braço direito encontra-se erguido e com uma flor-de-lis na mão, o esquerdo suporta um livro fechado sobre o qual se encontra um lenço branco e um menino despido em pé, de braços abertos, pernas ligeiramente fletidas, que o olha fixamente. Apresenta-se vestido com hábito franciscano, castanho, ornado por motivos florais e geométricos dourados. À cintura um cordão também dourado que cai levemente e volta para a mão do Menino. Nos pés calça umas sandálias castanhas e na cabeça tem um resplendor de prata.
Enquadrando o retábulo, há duas colunas compósitas de fuste liso decoradas com aplicações de folhagens de acanto e conchas que, juntamente com os nichos, suportam o ático, de frontão curvo e quebrado, com molduras sinuosas e elementos escultóricos que convergem num dossel central, criando um ponto focal visível importante.